Для полной очистки напитков от вредных примесей, рекомендуем перегонять в два этапа.
Первый этап- Перегон из браги в спирт-сырец в режиме Pot Still или дистилляции.
 - Подготовьтесь к перегону.
 - Соберите аппарат в нужном режиме.
 - Включите плиту на максимальную мощность.
 - На температуре 60 °C в кубе включите подачу холодной воды так, чтобы холодильник оставался холодным. Обычно это около 15−20% от максимального напора.
 - Если спирт-сырец выходит горячим, увеличьте напор воды. Оптимальная температура сырца около 20 °C.
 - Проводите перегон на максимальной мощности плиты, не обращая внимания на температуру в колонне.
 - Когда температура в кубе выше 98 °C и/или крепость дистиллята упала ниже 20°, завершите перегон — выключите плиту и подачу воды.
 - Слейте остатки браги, используя сливной кран или отсоедините колонну от куба и снимите крышку.
 - Если осталась брага — залейте и повторите процесс, если нет — ополосните куб водой.
 
Второй этапПерегон из спирта-сырца в готовый продукт в режиме дистилляции или укрепления. На этом этапе делаем дробный перегон — отбираем головы и хвосты от тела напитка. Выбор режима второй перегонки зависит от итогового напитка.
- Разведите спирт-сырец до 20−30°, вливая спирт в воду и размешивая ложкой.
 - Залейте получившийся раствор в куб, заполнив не более 80−95% его ёмкости в зависимости от типа браги.
 - Соберите аппарат в нужном режиме.
 - Включите плиту на максимальную мощность.
 - На температуре 60 °C в кубе включите подачу холодной воды.
 - Холодильник должен быть холодным, а дефлегматор немного тёплым.
 - Как только пошли головы (первые капли), уменьшите температуру плиты на столько, на сколько возможно, чтобы процесс отбора продолжался.
 - Покапельно отберите головы (как определить их объём смотрите в разделе «Сколько отбирать голов»).
 - По окончанию отбора голов, сохраните их в отдельной таре или вылейте.
 - Увеличьте мощность на плите и начните сбор тела.
 - Корректируйте напор воды смесителем и краном на входе в дефлегматор, чтобы поддерживать температуру в колонне на одном уровне. Небольшие колебания допускаются, но влияют на крепость и чистоту итогового продукта. Чем выше температура, тем быстрее процесс перегона, но ниже крепость и чистота продукта. Если делаете вторую перегонку в режиме дистилляции, то контролировать температуру в колонне не нужно.
 
Ближе к концу перегона, скорость выхода продукта начнёт падать. Значит, что скоро начнутся хвосты. Определить момент помогут признаки:
- крепость продукта упала ниже 40°;
 - температура в кубе поднялась до 95 °C и продукт перестал капать;
 - у спирта появился неприятный специфический запах.
 
Хвосты можно оставить в кубе, завершив перегон, либо увеличить нагрев на плите и собрать их в отдельную тару.
По окончанию перегона, выключите плиту, дайте аппарату остыть, разберите, слейте остатки сырца, промойте куб и колонну проточной водой.